Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms