Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms