Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms