Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp988F6VKC7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp988F6VKC7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zfp988F6VKC7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zfp988F6VKC7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp988F6VKC7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms