Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r48E9Q5D8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms