Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2Q1

Gm21103, Predicted gene, 21103, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21103E9Q2Q1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm21103E9Q2Q1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21103E9Q2Q1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms