Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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