Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt78E9Q0F0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt78E9Q0F0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt78E9Q0F0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt78E9Q0F0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms