Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms