Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsf1E9PWW9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rsf1E9PWW9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms