Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gcn1E9PVA8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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