Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl3E0CZ16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms