Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms