Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
3425401B19RikD3Z1D3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms