Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd1D3YXK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms