Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC048679D3YXE9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC048679D3YXE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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