Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms