Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms