Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatipB9EKE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms