Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1bB9EJ57 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms