Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms