Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms