Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU022751B1B0V2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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