Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf25B1AWN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms