Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxa1B1AUS7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxa1B1AUS7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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