Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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