Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint4A7TZF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint4A7TZF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms