Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms