Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms