Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Lcn6A2AJB9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn6A2AJB9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lcn6A2AJB9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn6A2AJB9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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