Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec16aA2AIX1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms