Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc163A2AGD7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms