Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms