Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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