Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SUT5

4930563M21Rik, RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms