Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms