Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms