Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scn2aA0A0J9YTW6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Scn2aA0A0J9YTW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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