Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms