Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Trim35Q8C006 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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