Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpreP49446 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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PtpreP49446 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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