Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprkP35822 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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