Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxc12Q8K5B8 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxc12Q8K5B8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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