Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Q3U6N9 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms