Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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