Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Capns2Q9D7J7 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Capns2Q9D7J7 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms