Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms