Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc18Q640L5 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms