Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.7 ms