Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Col5a3Q9JLI2 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Col5a3Q9JLI2 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Col5a3Q9JLI2 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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